Čo by ste mali vedieť
- Súbor FNA je súbor na zarovnanie DNA a sekvencie proteínov formátu FASTA.
- Otvorte jeden s Geneious.
- Konvertujte na FASTA a podobné formáty pomocou toho istého programu.
Tento článok vysvetľuje, čo je súbor FNA, ako ho otvoriť a ako ho uložiť do iného formátu, ako je FASTA, GB, VCF, obrázky atď.
Čo je súbor FNA?
Súbor s príponou FNA je súbor FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment, ktorý uchováva informácie o DNA, ktoré môže použiť softvér molekulárnej biológie.
Súbory FNA sa môžu použiť len na uchovávanie informácií o nukleových kyselinách, zatiaľ čo iné formáty FASTA obsahujú ďalšie informácie súvisiace s DNA, ako sú napríklad súbory s FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET alebo AA prípony súborov.
Tieto textové formáty FASTA pôvodne vznikli zo softvérového balíka s rovnakým názvom, ale teraz sa používajú ako štandard v aplikáciách na porovnávanie sekvencií DNA a proteínov.
FNA tiež odkazuje na niektoré technologické výrazy, ktoré nemajú nič spoločné s týmto formátom súboru, ako je konečné prijatie siete, možnosť rozšírenia názvu súboru/atribútu, architektúra siete Fujitsu a rýchla reklama susedov.
Ako otvoriť súbor FNA
Otvorte jeden v systéme Windows, macOS a Linux pomocou Geneious (je to zadarmo na 14 dní). Ak to chcete urobiť, prejdite do ponuky File > Import a vyberte import súboru cez From Filepoložka menu.
Je možné, že ho budete môcť otvoriť aj pomocou BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Ak tieto nápady nefungujú, skúste Notepad++ alebo iný textový editor. Súbor môže byť skutočne textový a ľahko čitateľný, alebo možno zistíte, že nemá nič spoločné s formátom FASTA, v takom prípade otvorenie súboru ako textového dokumentu môže odhaliť text, ktorý identifikuje, čo bolo použité na vytvorenie súboru. alebo v akom formáte je súbor.
Ako previesť súbor FNA
Nemôžeme to overiť, pretože sme to nevyskúšali, ale mali by ste byť schopní použiť Geneious na konverziu súboru do mnohých iných formátov, ako sú FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV a VCF. Môžete to urobiť prostredníctvom ponuky File > Export programu.
Ten istý program by mal byť schopný uložiť súbor do formátu PNG, JPG, EPS alebo PDF prostredníctvom File > Uložiť ako súbor obrázka.
Hoci bežne nemôžete jednoducho premenovať príponu súboru na niečo iné a očakávať, že bude fungovať rovnakým spôsobom, môžete premenovať súbor. FNA na súbor. FA, ak váš konkrétny softvér na sekvenovanie DNA rozpozná iba formát FA.
Namiesto premenovania prípon súborov budete chcieť použiť bezplatný konvertor súborov na konverziu iných typov súborov. V prípade súborov FNA a FA sa stane, že niektoré programy otvoria iba súbory s príponou FA, v takom prípade by malo premenovanie fungovať správne.
Stále to nejde otvoriť?
Ak po použití vyššie uvedených programov stále nemôžete otvoriť svoj súbor, možno zistíte, že prípona súboru v skutočnosti nečíta. FNA, ale niečo, čo vyzerá podobne.
Napríklad súbory FNG (Font Navigator Group) vyzerajú veľmi podobne ako „. FNA“, ale ak sa pozriete pozorne, iba prvé dve písmená sú rovnaké. Keďže sa prípony súborov líšia, znamená to, že majú iný formát súboru a s najväčšou pravdepodobnosťou nebudú fungovať s rovnakými programami.
To isté by sa dalo povedať o mnohých ďalších príponách súborov, ako sú FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) a FND (Windows Saved Search).
Myšlienkou je len zabezpečiť, aby prípona súboru znie. FNA. Ak áno, skúste znova použiť programy uvedené vyššie na otvorenie alebo konverziu. Ak máte iný typ súboru, preskúmajte jeho príponu a zistite, ktoré aplikácie sú potrebné na jeho otvorenie alebo konverziu.
FAQ
Ako otvoríte súbor FNA v Pythone?
Najprv konvertujte súbor FNA do formátu FASTA pomocou aplikácie tretej strany, ako je Geneious. Potom si môžete stiahnuť Biopython, súbor voľne dostupných nástrojov na biologické výpočty pre prácu v bioinformatike. Nakoniec si pozrite návod a kuchársku príručku Biopython, kde nájdete pokyny na prácu so súbormi FASTA.
Ako nájdem svoje čísla výrobcu FNA v nespracovanom súbore Ancestry?
Väčšinu údajov DNA si môžete stiahnuť z Ancestry.com vo formáte.txt. Avšak iba zákazníci, ktorých DNA bola analyzovaná pomocou sekvenovania novej generácie (NGS), majú možnosť stiahnuť si súbor VCF. Ak si chcete stiahnuť súbor VCF, musíte byť vlastníkom DNA, musíte mať DNA testovanú pomocou technológie NGS a mať vo svojom zariadení k dispozícii aspoň 350 MB miesta.
